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Praktikum Netzwerk- und Expressionsdaten-Analyse (SS2011)

Aktuelles

Passwortgeschützter Bereich

Die passwortgeschützte Seite wird zu Beginn des Semesters freigeschaltet.

  • Ort: Seminarraum 105/cip-pool, Amalienstr. 17
  • Beginn und Vorbesprechung: tba
  • Termin: im Vorlesungszeitraum: tba
  • Semesterferien: 2 Wochen Blockveranstaltung
  • Umfang: 10SWS (10P/Block)
  Zeitplan
Ein detaillierter Zeitplan mit verlinktem Material ist auf der passwortgeschützte Seite
zu finden.
Termin Thema Vortragender
tba Einführungsveranstaltung Prof. Ralf Zimmer
tba Expressionsdaten, Eine Übersicht tba
on demand DREAM - Der Wettbewerb 2011 tba
tba Expressiondaten, Analyse-Verfahren tba
tba Netzwerkbasierte Analysen und Modelle tba
tba Studentische Vorträge
tba Studentische Vorträge
tba Milestone A, Abnahme des Basissystems
Plenum
tba Milestone B, Abnahme Prototypen Plenum
tba SEMESTERENDE -
tba Milestone C, Abnahme Blockphasenkonzepte Plenum
tba Endabnahme Plenum
Betreuer
Vorkenntnisse
  • Grundstudium Bioinformatik (Bachelor oder Diplom)
  • Bioinformatik Programmierpraktikum
  • Genomorientiertes Programmierpraktikum
Beschreibung
Im Zentrum des Praktikums steht die Beschaffung, Analyse und Integration von Expression- und Netzwerkdaten. Die Teilnehmer entwickeln hier neue Methoden und erarbeiten zum Ende der Veranstaltung eine entsprechende Veröffentlichung.
Gelehrt werden aktuelle und klassische Verfahren. Als besonderer Anreiz die eigene Arbeit anzuwenden wird eine Teilnahme am international ausgeschriebenen DREAM Wettbewerb angestrebt.
Ablauf
Die Veranstaltung hat drei Teile:
  1. Seminar- und Methodenteil
  2. Implementierung eines neuartigen Verfahrens zur Analyse von Genexpressionsdaten
  3. Anwendung auf aktuelle Daten und Schreiben eines Papers
Zur Beachtung: Während des Seminarteils finden ggf. Vorträge auch Donnerstags statt um einen raschen Einstieg in die praktische Problemlösung zu finden.
Literatur


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