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Alternative Splicing Gallery

Detail view for swissprot protein SNX3_HUMAN and isoform O60493-3

Template: 2csk
Sequence Identity (Template - Swissprot): 0.75
Coverage of swissprot protein: 0.89440995

Alignment

SNX3_HUMAN	AETVADTRRLITKPQNLNDAYGPPSNFLEIDVSNPQTVGVGRGRFTTYEIRVKTNLPIFKLKESTVRRRYSDFEWLRSELERESKVVVPPLPGKAFLRQL
2csk		-----------------GSSGSSGSNFLEIDIFNPQTVGVGRARFTTYEVRMRTNLPIFKLKESCVRRRYSDFEWLKNELERDSKIVVPPLPGKALKRQL
SSE		-----------------CCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
VARSPLIC	                                                                                     SSSSSSSSSSSSSSS

SNX3_HUMAN	PFRGDDGIFDDNFIEERKQGLEQFINKVAGHPLAQNERCLHMFLQDEIIDKSYTPSKIRHA--
2csk		PFRGDEGIFEESFIEERRQGLEQFINKIAGHPLAQNERCLHMFLQEEAIDRNYVPGKSGPSSG
SSE		CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
VARSPLIC	SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS

Varsplic events:
VSP_012928 REPLACE 86-161 VVVPPLPGKAFLRQLPFRGDDGIFDDNFIEERKQGLEQFINKVAGHPLAQNERCLHMFLQDEIIDKSYTPSKIRHA => PCLRMTSEARSHGRTWCAQNDEKLFCD, affected aminoacids in template: 68-143 Color: Pink

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