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Alternative Splicing Gallery

Detail view for swissprot protein STX3_MOUSE and isoform Q64704-3

Template: 1dn1
Sequence Identity (Template - Swissprot): 0.6940639
Coverage of swissprot protein: 0.75778544

Alignment

STX3_MOUSE	MKDRLEQLKAKQLTQDDDTDEVEIAIDNTAFMDEFFSEIEETRLNIDKISEHVEEAKKLYSIILSAPIPEPKTKDDLEQLTTEIKKRANNVRNKLKSMEK
1dn1		----------------------------DRFMDEFFEQVEEIRGFIDKIAENVEEVKRKHSAILASPNPDEKTKEELEELMSDIKKTANKVRSKLKSIEQ
SSE		----------------------------CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VARSPLIC	                                      SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS                            

STX3_MOUSE	HIEEDE--VRSSADLRIRKSQHSVLSRKFVEVMTKYNEAQVDFRERSKGRIQRQLEITGKKTTDEELEEMLESGNPAIFTSGII-DSQISKQALSEIEGR
1dn1		SIEQEEGLNRSSADLRIRKTQHSTLSRKFVEVMSEYNATQSDYRERCKGRIQRQLEITGRTTTSEELEDMLESGNPAIFASGIIMDSSISKQALSEIETR
SSE		HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
VARSPLIC	                                                                                                    

STX3_MOUSE	HKDIVRLESSIKELHDMFMDIAMLVENQGEMLDNIELNVMHTVDHVEKARDETKRAMKYQGQARKKLIIIIVVVVVLLGILALIIGLSVGLK
1dn1		HSEIIKLENSIRELHDMFMDMAMLVESQGEMIDRIEYNVEHAVDYVERAV------------------------------------------
SSE		HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCHHHHHHCCCCCCCCCC------------------------------------------
VARSPLIC	                             SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS                                          


Varsplic events:
VSP_006346 REPLACE 227-289 EMLDNIELNVMHTVDHVEKARDETKRAMKYQGQARKKLIIIIVVVVVLLGILALIIGLSVGLK => AMIDRIENNMDQSVGFVERAVADTKKAVKYQSEARRKKIMIMICCIILAIILASTIGGIFA, affected aminoacids in template: 201-221 Color: Pink
VSP_006341 REPLACE 39-72 IEETRLNIDKISEHVEEAKKLYSIILSAPIPEPK => NFHGILSYLLRLSSHE, affected aminoacids in template: 10-43 Color: Pink



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