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Alternative Splicing Gallery

Detail view for swissprot protein CP2B2_RAT and isoform P04167-2

Template: 2bdm
Sequence Identity (Template - Swissprot): 0.7801724
Coverage of swissprot protein: 0.9450102

Alignment

CP2B2_RAT	MEPSILLLLALLVGFLLLLVRGHPKSRGNFPPGPRPLPLLGNLLQLDRGGLLNSFMQLREKYGDVFTVHLGPRPVVMLCGTDTIKEALVGQAEDFSGRGT
2bdm		---------------------------GKLPPGPSPLPVLGNLLQMDRKGLLRSFLRLREKYGDVFTVYLGSRPVVVLCGTDAIREALVDQAEAFSGRGK
SSE		---------------------------CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCEEEEEECHHHHHHHHHCCCCCCCCEECC
VARSPLIC	                                                                                                    

CP2B2_RAT	IAVIEPIFKEYGVIFANGERWKALRRFSLATMRDFGMGKRSVEERIQEEAQCLVEELRKSQGAPLDPTFLFQCITANIICSIVFGERFDYTDRQFLRLLE
2bdm		IAVVDPIFQGYGVIFANGERWRALRRFSLATMRDFGMGKRSVEERIQEEARCLVEELRKSKGALLDNTLLFHSITSNIICSIVFGKRFDYKDPVFLRLLD
SSE		CECCCCCCCCCECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH
VARSPLIC	                                                                                                    

CP2B2_RAT	LFYRTFSLLSSFSSQVFEFFSGFLKYFPGAHRQISKNLQEILDYIGHIVEKHRATLDPSAPRDFIDTYLLRMEKEKSNHHTEFHHENLMISLLSLFFAGT
2bdm		LFFQSFSLISSFSSQVFELFSGFLKYFPGTHRQIYRNLQEINTFIGQSVEKHRATLDPSNPRDFIDVYLLRMEKDKSDPSSEFHHQNLILTVLSLFFAGT
SSE		HHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VARSPLIC	                                                                         I                          

CP2B2_RAT	ETGSTTLRYGFLLMLKYPHVTEKVQKEIDQVIGSHRPPSLDDRTKMPYTDAVIHEIQRFADLAPIGLPHRVTKDTMFRGYLLPKNTEVYPILSSALHDPQ
2bdm		ETTSTTLRYGFLLMLKYPHVTERVQKEIEQVIGSHRPPALDDRAKMPYTDAVIHEIQRLGDLIPFGVPHTVTKDTQFRGYVIPKNTEVFPVLSSALHDPR
SSE		HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCCCEEECCEEECCCCEEEECHHHHHCCCC
VARSPLIC	                                                                                                    

CP2B2_RAT	YFDHPDTFNPEHFLDADGTLKKSEAFMPFSTGKRICLGEGIARNELFLFFTTILQNFSVSSHLAPKDIDLTPKESGIAKIPPTYQICFSAR-
2bdm		YFETPNTFNPGHFLDANGALKRNEGFMPFSLGKRICLGEGIARTELFLFFTTILQNFSIASPVPPEDIDLTPRESGVGNVPPSYQIRFLARH
SSE		CCCCCCCCCHHHHECCCCCECCCCCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECC
VARSPLIC	                                                                                            


Varsplic events:
VSP_011939 REPLACE 274-274 K => KVSPAWMRE, affected aminoacids in template: 246-246 Color: Yellow



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